Uma missão francesa enviada por
João Calvino se estabeleceu, em
1557, numa das ilhas da
Baía de Guanabara, fundando a
França Antártica. No mesmo ano, esses calvinistas franceses realizaram o primeiro culto protestante no Brasil e, de acordo com alguns, da própria América. Mas, pela predominância católica, foram obrigados a defender sua fé ante as autoridades, elaborando a
Confissão de Fé de Guanabara, assinando, com isso, sua sentença de morte, pondo um fim no movimento.
Com a vinda da família real portuguesa ao Brasil e abertura dos portos a nações amigas, através do
Tratado de Comércio e Navegação comerciantes ingleses estabeleceram a
Igreja Anglicana no país, em
1810. Seguiram a implantação de igrejas de imigração: alemães trouxeram o
luteranismo em
1824.
Em
1855,
Robert Reid Kalley, missionário autônomo escocês, fundou igrejas
Congregacionais constituindo primeiro trabalho Protestante permanente em terras brasileiras. Mais tarde, em 1859, a igreja
Presbiteriana foi fundada por
Ashbel Green Simonton no Rio de Janeiro. Apesar de uma inicial desavença entre Kalley e Simonton, logo os dois passaram a cooperar. Quando Kalley precisou partir do Brasil, providenciou a formação de pastores brasileiros em um Seminário da Inglaterra (a Escola de Pastores do Rev.
Charles Spurgeon) e, providenciou também que outro missionário independente, o batista
Salomão Ginsburg, fosse enviado para cá.
Em
1871, o primeiro grupo batista se estabeleceu em
Santa Bárbara d'Oeste, no
Estado de São Paulo, trazida por missionários
americanos. Em
1907 fundava-se a
Convenção Batista Brasileira.
Em
1910, o Brasil receberia o
pentecostalismo, com a chegada da
Congregação Cristã no Brasil e da
Assembléia de Deus. Esta, em particular, foi trazida ao Brasil por dois missionários
suecos, Daniel Berg e Gunnar Vingren, e estabeleceu-se inicialmente no norte, no
Pará. Em
1922, chega ao país o
Exército de Salvação, igreja reformada de origem
inglesa, pelas mãos de David Miche e esposa, um casal de missionários
suíços.
Em
1932, alguns ministros da
Assembléia de Deus devolveram voluntariamente suas credenciais de obreiros e organizaram
Igreja de Cristo no Brasil em Mossoró/RN.
Nos anos
1950 surge uma nova onda do pentecostalismo, com a influência de movimentos de cura divina e expulsão de demônios que geraram diferentes denominações, tais como: Igreja Pentecostal
O Brasil para Cristo fundada pelo já falecido missionário Manoel de Mello. Em 1962 surge a
Igreja Pentecostal Deus é Amor, fundada pelo missionário David Miranda. Também nesta época várias igrejas protestantes que eram tradicionais adicionaram o fervor pentecostal, como exemplos, a
Igreja Presbiteriana Renovada, a
Igreja Cristã Maranata, a
Convenção Batista Nacional e a
Igreja do Evangelho Quadrangular, que chegou ao Brasil trazida pelos missionários
Harold Edwin Williams e Jesus Hermírio Vaquez, que se instalaram inicialmente na cidade mineira de
Poços de Caldas. A
Igreja Cristã Maranata foi fundada em Outubro de
1968 no morro do Jaburuna em
Vila Velha,
Espírito Santo por quatro antigos membros da Igreja Presbiteriana do Centro de Vila Velha.
A década de
1970 viu nascer o
movimento neopentecostal, com igrejas que enfatizam a prosperidade, como a
Igreja Universal do Reino de Deus, fundada por
Edir Macedo, em 1977; a
Igreja Internacional da Graça de Deus, fundada por
Romildo Ribeiro Soares, entre muitas outras. É também nessa década que mesmo a Igreja Católica no Brasil começa a sofrer influência dos movimentos pentecostais através da
Renovação Carismática Católica, um movimento originário dos
EUA.
Recentemente cresceram as chamadas igrejas neopentecostais com foco nas classes média e alta, com um discurso mais liberado quanto aos costumes e menos ênfase nas manifestações pentecostais. Entre elas podemos citar a
Igreja Apostólica Renascer em Cristo, fundada por
Estevam e
Sonia Hernandez, a
Comunidade Evangélica Sara Nossa Terra, fundada por
Robson Rodovalho e a
Igreja Evangélica Cristo Vive, fundada por Miguel Ângelo.